Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Top3bQ9Z321 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Top3bQ9Z321 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
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Top3bQ9Z321 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Top3bQ9Z321 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Top3bQ9Z321 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Top3bQ9Z321 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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