Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms