Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ercc4Q9QZD4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ercc4Q9QZD4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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