Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms