Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tomm40Q9QYA2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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