Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Limd1Q9QXD8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms