Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trim44Q9QXA7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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