Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms