Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlr5Q9JLF7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms