Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm1Q9JLF6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms