Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms