Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ybx3Q9JKB3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms