Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1fQ9JIS7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms