Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccl28Q9JIL2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccl28Q9JIL2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccl28Q9JIL2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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