Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim39Q9ESN2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim39Q9ESN2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trim39Q9ESN2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim39Q9ESN2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms