Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa8Q9DCJ5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms