Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt112Q9DCG9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trmt112Q9DCG9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms