Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnk1dQ9DC28 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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