Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms