Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf6Q9DBU5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf6Q9DBU5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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