Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc7Q9D541 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7Q9D541 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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