Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms