Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krtap5-3Q9D226 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krtap5-3Q9D226 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms