Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms