Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms