Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Zbed3Q9D0L1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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