Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mis18aQ9CZJ6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms