Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms