Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BccipQ9CWI3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms