Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Nicn1Q9CQM0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms