Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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