Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Higd2aQ9CQJ1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms