Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms