Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pbx4Q99NE9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pbx4Q99NE9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pbx4Q99NE9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pbx4Q99NE9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pbx4Q99NE9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pbx4Q99NE9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Pbx4Q99NE9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pbx4Q99NE9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pbx4Q99NE9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pbx4Q99NE9 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms