Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms