Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hps4Q99KG7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hps4Q99KG7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hps4Q99KG7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms