Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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