Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Derl1Q99J56 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms