Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctu1Q99J10 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctu1Q99J10 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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