Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms