Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usb1Q91W78 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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