Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Krt79Q8VED5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt79Q8VED5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms