Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Slc6a20aQ8VDB9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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