Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Vmn1r200Q8R281 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Vmn1r200Q8R281 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Vmn1r200Q8R281 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Vmn1r200Q8R281 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Vmn1r200Q8R281 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Vmn1r200Q8R281 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Vmn1r200Q8R281 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Vmn1r200Q8R281 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Vmn1r200Q8R281 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Vmn1r200Q8R281 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Vmn1r200Q8R281 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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