Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf183Q8QZS5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms