Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms