Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf13Q8K2W6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms