Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scara5Q8K299 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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