Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sphk1Q8CI15 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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