Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Usp27Q8CEG8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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